由于富硒土壤往往伴生汞、铜、镉、铅、铬等重金属,这类重金属含量超过十壤安全标准,不仅影响硒的有效性,还可能对农产品的安全造成影响。无论在富硒地区还是非富硒地区,重金属都会伴随着土壤一生物系统的迁移进人人体,进而对人体健康产生一定影响。建议富硒地区特别是重金属伴生地区要密切关注重金属的潜在危害性。除了定期测量土壤重金属的含量外,也要杜绝使用不合格农药和化肥等农资用品,杜绝污水灌溉农田等人为因素导致的土壤重金属积累。对于已经出现重金属含量超标问题的富硒地区,应采取土壤重金属污染修复技术进行土壤修复,如物理化学方法、植物方法和微生物方法等钝化土壤中的重金属,活化土壤中的硒。硒与重金属在作物生长过程中存在着相互作用。一方面,硒在土壤中可以拮抗铅、镉和汞等重金属元素,与重金属结合可以降低重金属的活性;另一方面,硒促进谷胱甘肽过氧化物酶合成,提高植物抗氧化能力,缓解重金属胁迫。因此,在土壤天然富硒区,尤其是在重金属含量超标的地区,可以通过天然富硒与外源施硒二者结合的方式实现土壤重金属治理的效果。另外,利用农作物对硒和重金属吸收的差异,筛选出富硒且重金属吸收率低的农作物,有利于该地区的土壤保值和增值以及农业的良性发展。