目前，作物施硒的方式有多种，包括土壤施硒、拌种、浸种、茎部施硒和叶面喷施等。芬兰早在20世纪80年代就开始施用亚硒酸钠，以提高植物的含硒量。不同的施硒方式具有各自的优缺点，通过硒肥来提高农产品中硒的含量是一个基本途径。国内外大多数补硒方式是施用亚硒酸钠，通过亚硒酸钠溶液浸种或喷施，使硒被农作物吸收，生产出一定含硒量的农产品。其作物种类包括水稻、玉米、大豆、茶叶和蔬菜等。但亚硒酸钠使用容易引起农产品质量安全及环境风险等诸多问题。目前国内出现了氨基酸、腐殖酸等鳌合态硒和纳米硒等新型产品类型，以避免亚硒酸钠施用的负面影响。
（一）土壤施硒
土壤施硒即把无机硒盐粉通过灌溉或直接混于耕作层。通过土壤施硒将硒补充到土壤系统中使植物吸收转化，以满足人和动物在膳食中对硒的需求，是比较持久而稳定的方法。在土壤中底施或追施富硒复混肥、硒矿粉、亚硒酸钠等，不仅能增加小麦茎、叶以及籽粒的硒含量，而且可以提高小麦籽粒中的赖氨酸含量，从而提高小麦的营养值。给植物施硒肥，既可以增加植物的硒含量，又可使畜禽摄取自然的有机硒，这种方法以美国、芬兰和新四兰最为常用。土壤施硒通过改善土壤硒环境，增加植物内硒含量。在贫硒地区进行土壤施硒肥、改善土壤贫硒情况的同时也发现不少问题，包括：①作物吸收率低；②产品中硒水平不易调控：③对环境的负影响 。因此选择一个高效、安全、和谐的富硒手段是当前研究的重点。植物的种类对硒的富集起着至关重要的作用，运用先进的生物技术，对植物进行培育改良，选育富硒能力强的植物。
（二）硒拌种、浸种
对种子浸种或者拌种也可以增加作物的硒含量。 Gisse - Nielson 的研究表明，拌种处理所需的硒量，比叶面喷施要多20倍左右。研究发现，一定浓度的亚硒酸钠浸种小麦种子能够提高小麦产量和小麦含硒量，但拌种和浸种要严格控制亚硒酸钠的浓度，防止对种子产生毒害，影响种子发芽。
（三）茎部施硒
果树树干注射式施肥法是近年来广泛应用的一种新型施肥方法，茎部注干施晒不受土壤因素影响，目具有营养成分易调控和作物对养分吸收利用率高以仪不污染环境等特点。分别对枣树、金橘和苹果进行茎干注射发现，茎干施硒也是一种有效的富硒方法。果树注干施用硒需要关注能够提高植物对硒吸收转化效率的助剂，同时因注干造成的伤口会增加果树病虫害风险。
（四）叶面喷施硒
土壤施硒量大、投资高，拌种又不易操作且拌种和土壤施硒均易污染环境，在生产中这两种方式的应用受到限制。叶面施硒可以减少土壤因素对施硒效率的影响，从而大大降低硒的施用量。如果在亚硒酸盐溶液中加人一些表面活性剂，植物对硒的吸收可增加20%~200%。叶面喷施要掌握好硒的浓度，不宜太高，以免对植物造成伤害。在小白菜生长过程中发现，土壤施硒和叶面喷施均能达到富硒效果，但是土壤施硒会延迟小白菜出苗时间，而叶面喷施可显著提高小白菜的硒含量。叶面施硒需要关注植物的生育期，不同作物对硒的吸收转化规律不同，同时不同生育期施用也会影响植物对硒的吸收与转化。不同生育期叶面喷施亚硒酸钠，均能够提高谷子籽粒含硒量，其中灌浆期叶面适量喷施外源硒是改善谷子品质性状，提高谷子硒含量、有机硒转化率和硒收获指数的最佳时期。（五）水培植物
对青菜、油菜和甘蓝等作物进行水培施硒，也可得到比较理想的效果，水培植物适合于工厂化生产，特别是蔬菜和产品附加值较高的作物；但相关的技术需要进一步研发，包括硒含量的控制以及相关废液的处理等。
